3. Slovenska nogometna liga je sestavljena iz štirih skupin. V 3. SNL - Vzhod tekmuje 14 klubov iz MNZ Lendava in MNZ Murska Sobota, ki se v dvokrožnem sistemu 26 krogov merijo za napredovanje v 2. SNL.
Zmagovalna ekipa 3. SNL – Vzhod si zagotovi pravico nastopa v dodatnih kvalifikacijah za popolnitev 2. SNL, v kateri zmagovalec kvalifikacij nadomesti eno od dveh zadnjeuvrščenih ekip minulega tekmovalnega leta.
V dveh kvalifikacijskih tekmah, ki potekata na prizoriščih obeh klubov, se prvouvrščena ekipa 3. SNL - Vzhod pomeri z eno od treh zmagovalk 3. SNL. Pare dodatnih kvalifikacij za popolnitev 2. SNL določi žreb. Po končanem prvenstvu dve zadnjeuvrščeni ekipi tekmovalnega leta neposredno izpadeta iz 3. SNL - Vzhod, glede na izpadle ekipe iz 2. SNL pa lahko tudi 11. in 12. uvrščena ekipa.
V tekmovanjih NZS, med katera spada tudi 3. SNL, lahko nastopajo le tisti klubi, ki so si tekmovalno pravico pridobili s športnimi rezultati in imajo ustrezno licenco NZS za nastopanje. Pogoji za pridobitev licence in postopki za izvedbo licenciranja so opredeljeni v posebnem Pravilniku NZS za licenciranje nogometnih klubov.
Pravico do napredovanja v 3. SNL - Vzhod si zagotovita prvaka lig MNZ Lendava in MNZ Murska Sobota. V sezonah 2016/17 in 2017/18 tekmovanje v 3. SNL - Vzhod vodi MNZ Lendava.
